长期喝反渗透净水器水可能会导致微量元素、矿物质的丢失，从而引起机体营养不良，进一步造成抵抗力下降，容易出现感冒等疾病。

净水器可以通过过滤的方式把水中的有害物质如铁锈、沙石等过滤出来，同时可以把水中多余的氯气以及某些化学物品如农药等清除掉。在去掉有害物质的同时，也可能去掉了有益的颗粒物质，如硫酸根、钙镁离子等。钙镁离子在心血管方面发挥着比较重要的作用，如果长期的没有摄入这些物质，会对血管造成危害，从而增加了心脑血管疾病的发生率。